Νικόλαος Δικαίος: Ο επιστήμονας από το Άστρος που καταπολεμά τον καρκίνο (vid)

Στην κάμερα του Astros News και τον Κώστα Λέγκουρδα, μίλησε ο διακεκριμένος επιστήμονας με καταγωγή από το Άστρος, Νικόλαος Δικαίος.

Ο επίκουρος καθηγητής στο τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών του Πανεπιστημίου του Σάρρεϋ στην Αγγλία, μας μίλησε για τις σπουδές του στο Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών, στο τμήμα Φυσικής, για το μεταπτυχιακό του και την υποτροφία που τον οδήγησε στην Αγγλία. Εκεί, άλλωστε, διαπρέπει και μαζί με την ομάδα του, έχει καταφέρει να βοηθήσει στην πρόληψη και στην καταπολέμηση μορφών καρκίνου.

Επακόλουθο της λαμπρής πορείας του, ήταν η βράβευσή του από διεθνή φορέα για την έρευνά του πάνω στην αντιμετώπιση του καρκίνου του προστάτη.

Παράλληλα, στο βίντεο που ακολουθεί, ο Νικόλαος Δικαίος επισημαίνει τα προβλήματα και τις αγκυλώσεις που δεν αφήνουν τέτοιες προσπάθειες να ευδοκιμήσουν στα ελληνικά πανεπιστήμια, αναφέροντας μάλιστα ως μείζον πρόβλημα την ανομία ορισμένων ομάδων που δρουν μέσα στα πανεπιστημιακά ιδρύματα και τις μορφές βίας που ασκούν.

Τέλος, δίνει τις συμβουλές του στους φοιτητές που είτε ξεκινούν τώρα τις σπουδές τους είτε βρίσκονται στο στάδιο της αποφοίτησης, ώστε να κάνουν πράξη τα όνειρά τους.

Το βιογραφικό του Νικόλαου Δικαίου

Νικόλαος Δικαίος, PhD                         

Λέκτορας Ιατρικής Φυσικής, Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών, Πανεπιστήμιο του Surrey

E-mail: n.dikaios@gmail.com; Τηλέφωνο: +44 7751764502

Εκτεταμένη εμπειρία στον τομέα της βιοϊατρικής τεχνολογίας με συγκέντρωση στην ιατρική φυσική, τη μαθηματική μοντελοποίηση, τη βιοπληροφορική και την ακτινολογία. Μεγάλη εμπειρία στη λήψη δεδομένων στη μαγνητική τομογραφίας και τομογραφία ποζιτρονίων, ανακατασκευή εικόνων, εκτίμηση θορύβου, αναγνώριση μορφών και μηχανική μάθηση. Ικανότητα μετάφρασης νέων τεχνολογιών στην κλινική, αποτελεσματική επικοινωνία με επιστήμονες από διαφορετικούς τομείς.

2011                Διδακτορικό στην Ιατρική Φυσική, Wolfson Brain Imaging Centre, Πανεπιστήμιο του Cambridge, Cambridge, Ηνωμένο Βασίλειο

2007                MSc στη Βιοϊατρική Τεχνολογία, Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Πατρών, Ελλάδα

2005                Πτυχίο Φυσικής, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών, Ελλάδα

2016 - παρόν   Λέκτορας Ιατρικής Φυσικής, Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών, Πανεπιστήμιο του Surrey

2011 - 2016     Μεταδιδακτορικός, Τμήμα Ιατρικής Φυσικής και Βιοτεχνολογίας, Πανεπιστήμιο του Λονδίνου (UCL), Λονδίνο, Ηνωμένο Βασίλειο

2006  - 2007    Ερευνητής, Hammersmith Imanet Ltd, GE Healthcare Biosciences, Λονδίνο, Ηνωμένο Βασίλειο

2017                ISMRM Summa Cum Laude (βράβευση)

2015                ISMRM Magna Cum Laude (βράβευση)

2013-2015       ISMRM χορήγηση χρηματοδότησης

2013                ISMRM Summa Cum Laude (βράβευση)

2009                IEEE NSS / MIC υποτροφία ασκουμενου

2007                Cambridge Trusts (υποτροφία διδακτορικού)

2007                Ίδρυμα ΜΠΑΚΑΛΑΣ (υποτροφία διδακτορικού)

Διεθνής Εταιρεία Μαγνητικού Συντονισμού στην Ιατρική

Ινστιτούτο Ηλεκτρολόγων και Ηλεκτρονικών Μηχανικών

Όμιλος αποφοιτων του Πανεπιστημίου του Cambridge

• Διόρθωση απορρόφησης και σκέδασης σε Τομογραφία Εκπομπής Ποζιτρονίων
• Αριθμητικές προσομοιώσεις στην ιατρική φυσική
• Αλγόριθμοι προσδοκίας-μεγιστοποίησης (EM) για 4D ανακατασκευή με διόρθωση αναπνευστικής κίνησης
• Βελτιστοποίηση των πρωτοκόλλων λήψης δεδομένων σε Μαγνητική Τομογραφία για την εκτίμηση αναπνευστικής κίνησης σε υψηλή χρονική ανάλυση
• Προγραμματιστής σε λογισμικό ανοικτού κώδικα για ανακατασκευή εικόνων από Τομογράφους (STIR 2: software for tomographic image reconstruction)
• Ανακατασκευή δεδομένων από Μαγνητικούς Τομογράφους με υψηλή υποδειγματολειψια, λαμβάνοντας υπόψιν τα μεμονωμένα αραιά δεδομένα (sparse) και διαδικασίες εξαϋλωσης σειράς
• Διάγνωση και χαρακτηρισμός καρκίνου βασιζόμενη σε πολυπαραμετρική Μαγνητική Τομογραφία
• Βαθιά συνελικτικά νευρωνικά δίκτυα για τη βελτίωση της διάγνωσης καρκίνου
• Ποσοτικοποίηση μεταβολικής δραστηριότητας χρησιμοποιώντας  Μαγνητική Φασματοσκοπία (MRS) πρωτονίων (1Η) και υπέρ-πολωμένων [1-13C]
• Θεραπεία καρκίνου με πρωτόνια: Απεικόνιση κατά τη διάρκεια της θεραπείας προκειμενου να βελτιωθεί η στοχοποίηση του καρκίνου

Προγραμματισμός πρωτοκόλλων λήψης δεδομένων σε Μαγνητικούς Τομογράφους (Philips, Siemens)

Λειτουργικά συστήματα:          Unix, Windows

Επιστημονικο Λογισμικο:        NVIDIA Deep Learning, SPSS, jMRUI Software, Analyze, Software for Tomographic Image Reconstruction (contributed as a developer), Image registration toolkit (ITK), Monte Carlo simulation (SimSET, GATE)

Script γλώσσες:                        bash, sh

Γλώσσες προγραμματισμού:     C ++, Python, Matlab, Fortran

06/2006           Αξιολόγηση αλγοριθμου διόρθωσης Σκέδασης σε Τομογράφο Εκπομπής Ποζιτρονίων υλοποιημένο στο STIR, 5TH ESBME conference, Πάτρα, Ελλάδα

10/2009           Ανακατασκευή με διόρθωση αναπνευστικής κίνησης στο STIR, STIR user’s meeting, Συνέδριο IEEE MIC, Orlando, FL, ΗΠΑ

05/2012           Διαγνωστικά μοντέλα βασιζόμενα σε πολυπαραμετρική Μαγνητική Τομογραφία σαν εργαλείο διάγνωσης καρκίνου στη μεταβατική ζώνη του προστάτη. Συνέδριο ISMRM, Melbourne, Αυστραλία

05/2013           Ανάπτυξη και αξιολόγηση ξεχωριστών διαγνωστικών μοντέλων για την περιφερική και τη μεταβατική ζώνη του προστάτη βασισμένα στην ενισχυμένη με δυναμική αντίθεση μαγνητική τομογραφία για την διάγνωση καρκίνου του προστάτη: Έχει σημασία η θέση του καρκίνου?, Συνέδριο ISMRM, Salt Lake city, Utah, ΗΠΑ (Summa Cum Laude award)

02/2014           Υποβοηθούμενη από υπολογιστή διάγνωση καρκίνου στη μεταβατική ζώνη του προστάτη βασισμένη σε πολυπαραμετρική Μαγνητική Τομογραφία, Συνέδριο BIR, Λονδίνο, Ηνωμένο Βασίλειο

09/2014           Αξιόπιστη ποσοτικοποίηση παραμέτρων από ενισχυμένη με δυναμική αντίθεση μαγνητική τομογραφία χρησιμοποιώντας Bayesian αλγοριθμους. Μπορεί να βοηθήσει τη διάγνωση καρκίνου? Σεμινάριο στην Ιατρική Απεικόνιση, Τμήμα Ιατρικής και Υγείας, Leeds, Ηνωμένο Βασίλειο

05/2015           Μηχανές Διανυσματων Υποστήριξης με Νευρωνικά Δίκτυα βασισμένα σε πολυπαραμετρική Μαγνητική Τομογραφία για την διάγνωση καρκίνου στη μεταβατική ζώνη του προστάτη, Συνέδριο ISMRM, Toronto, Ontario, Καναδάς (Magna Cum Laude award)

05/2017           Βαθιά συνελικτικά νευρωνικά δίκτυα για τη Βελτίωση της Διάγνωσης Καρκίνου του Προστάτη, Συνέδριο ISMRM, Honolulu, HI, ΗΠΑ (Summa Cum Laude award)

Magnetic Resonance in Medicine, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, IEEE Transactions on , Medical Imaging, Medical Physics, Physics in Medicine and Biology, PLOS One, Cellular Physiology and Biochemistry, British Journal of Radiology, European Radiology, Computer Methods and Programs in Biomedicine

ΚΑΤΑΛΟΓΟΣ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΩΝ

Δημοσιεύσεις: Διδακτορική Διατριβή, 24 δημοσιεύσεις σε διεθνή περιοδικά (10 σαν πρώτος συγγραφέας) με 564 παραθέσεις, σχηματίζοντας h-index 12, (Google Scholar).

https://scholar.google.co.uk/citations?user=gHEsz9cAAAAJ&hl=en

ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ ΣΕ ΔΙΕΘΝΗ ΠΕΡΙΟΔΙΚΑ

1. Aldaqadossi HA, Khairy H, Kotb Y, Hussein HA, Shaker H, Dikaios N. Prediction of pediatric PCNL outcomes using contemporary scoring systems. J Urol. 2017 (in press).
2. Dikaios N, Atkinson D, Tudisca C, Purpura P, Forster M, Ahmed H, Beale T, Emberton M, Punwani S. A comparison of Bayesian and non-linear regression methods for robust estimation of pharmacokinetics in DCE-MRI and how it affects cancer diagnosis. Comput Med Imaging Graph. 2017; 56:1-10.
3. Latifoltojar A, Hall-Craggs M, Rabin N, Popat R, Bainbridge A, Dikaios N, … , Yong K. Magnetic Resonance Imaging in newly diagnosed multiple myeloma: Early changes in lesional signal fat fraction predict disease response. British Journal of Haematology 2017; 176(2):222-233.
4. Latifoltojar A, Hall-Craggs M, Bainbridge A, Yong K, Dikaios N, … , Punwani S. Whole-body MRI quantitative biomarkers predict response in patients with newly diagnosed symptomatic multiple myeloma following Bortezomib induction. Eur. Radiol. 2017 (in press).
5. Sidhu HS, Benigno S, Ganeshan B, Dikaios N, … , Punwani S. Textural analysis of multiparametric MRI detects transition zone prostate cancer. Eur. Radiol. 2017; 27(6): 2348-2358.
6. Bhatnagar G, Dikaios N, Prezzi D,…, Taylor SA. Changes in Dynamic Contrast Enhanced pharmacokinetic and Diffusion Weighted Imaging parameters reflect response to anti-TNF therapy in Crohn's Disease. The British journal of radiology 2015; 88(1055): 2015-47
7. Latifoltojar A, Dikaios N, Ridout A,…, Punwani S. Evolution of multi-parametric MRI quantitative parameters following transrectal ultrasound-guided biopsy of the prostate. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2015; 18(4): 343-51
8. N Dikaios, J Alkalbani, M Abd-Alazeez,…, S Punwani: Zone-specific logistic regression models improve classification of prostate cancer on multi-parametric MRI. Eur. Radiol. 2015; 25(9):2727-37.
9. M Abd-Alazeez, N Ramachandran, N Dikaios,…, S Punwani: Multiparametric MRI for detection of radiorecurrent prostate cancer: added value of apparent diffusion coefficient maps and dynamic contrast-enhanced images. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2015;18(2):128-36
10. Abd-Alazeez M, Ahmed HU, Arya M, Allen C, Dikaios N, Freeman A, Emberton M, Kirkham A. Can multiparametric magnetic resonance imaging predict upgrading of transrectal ultrasound biopsy results at more definitive histology? Urol Oncol. 2014;32(6):741-7.
11. E Panagiotaki, RW Chan, N Dikaios, HU Ahmed, J O'Callaghan, A Freeman, D Atkinson, S Punwani, DJ Hawkes, DC Alexander: Microstructural Characterization of Normal and Malignant Human Prostate Tissue With Vascular, Extracellular, and Restricted Diffusion for Cytometry in Tumours Magnetic Resonance Imaging. Invest Radiol. 2015; 50(4):218-27
12. N Dikaios, Simon Arridge, V Hamy, S Punwani, D Atkinson: Direct parametric reconstruction from undersampled (k, t)-space data in dynamic contrast enhanced MRI. Med Image Anal. 2014; 18(7): 989-1001.
13. N Dikaios, J Alkalbani, HS Sidhu,…, S Punwani: Logistic regression model for diagnosis of transition zone prostate cancer on multi-parametric MRI. Eur Radiol. 2015; 25(2):523-32
14. B Trémoulhéac, N Dikaios, D Atkinson, S Arridge: Dynamic MR image reconstruction-separation from under-sampled (k-t)-space via low-rank plus sparse prior IEEE Trans Med Imaging. 2014; 33(8):1689-701.
15. V Hamy, N Dikaios, S Punwani,…, D Atkinson: Respiratory motion correction in dynamic MRI using robust data decomposition registration - Application to DCE-MRI. Med Image Anal. 2013; 18(2):301-313.
16. N Dikaios, S Punwani, V Hamy,…, D Atkinson: Noise estimation from averaged diffusion weighted images: Can unbiased quantitative decay parameters assist cancer evaluation? Magn Reson Med. 2013; 71(6):2105-17.
17. JC Makanyanga, D Pendsé, N Dikaios,… , SA Taylor: Evaluation of Crohn's disease activity: Initial validation of a magnetic resonance enterography global score (MEGS) against faecal calprotectin. Eur Radiol. 2013; 24(2):277-87
18. N Dikaios, TD Fryer: Registration-weighted motion correction for PET. Med Phys. 2012; 39(3):1253-64.
19. K Thielemans, C Tsoumpas, S Mustafovic, T Beisel, P Aguiar, N Dikaios, MW Jacobson: STIR: software for tomographic image reconstruction release 2. Phys Med Biol. 2012; 57(4):867-83.
20. N Dikaios, D Izquierdo-Garcia, MJ Graves, V Mani, ZA Fayad, TD Fryer: MRI-based motion correction of thoracic PET: initial comparison of acquisition protocols and correction strategies suitable for simultaneous PET/MRI systems. Eur Radiol. 2011; 22(2):439-46.
21. N Dikaios, TD Fryer: Improved motion-compensated image reconstruction for PET using sensitivity correction per respiratory gate and an approximate tube-of-response backprojector. Med Phys. 2011; 38(9):4958-70.
22. N Dikaios, TD Fryer: Acceleration of motion-compensated PET reconstruction: ordered subsets-gates EM algorithms and a priori reference gate information. Phys Med Biol. 2011; 56(6):1695-715.
23. N Dikaios, K Dinelle, T Spinks, K Nikita, K Thielemans: Processing of transmission data from an uncollimated single photon source. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A 2006; 569(2):416-420.
24. N Karakatsanis, N Sakellios, NX Tsantilas, N Dikaios,… , K Nikita: Comparative evaluation of two commercial PET scanners, ECAT EXACT HR+ and Biograph 2, using GATE. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A 2006; 569:368-372.

ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ ΣΕ ΣΥΝΕΔΡΙΑ

1. N Dikaios, EW Johnston, HS Sidhu, et al: Deep learning to improve prostate cancer diagnosis. ISMRM 2017. Summa Cum Laude award
2. N Dikaios, CG Daniels, F O’Callaghan, et al: Quantitative Analysis of Hyperpolarized [1-13C]pyruvate Metabolic Kinetics Using Bayesian Inference Algorithms. ISMRM 2017.
3. E Johnston, M Antonelli, N Dikaios, et al: Improving the Reproducibility of Quantitative Imaging Metrics for Multicentre Multiparametric Prostate MRI Trials. ISMRM 2017.
4. E Johnston, C Allen, M Antonelli, N Dikaios, et al: Single Slice Vs. Volumetric Analysis of Multiparametric Prostate MRI Metrics. ISMRM 2017.
5. N Dikaios, J. Alkalbani, A. Kirkham, C. Allen, et al: Support Vector Neural Networks versus Logistic Regression MR based diagnostic model for classification of transition zone prostate cancer. ISMRM 2015. Magna Cum Laude award
6. N. Dikaios, S. Punwani, and D. Atkinson. Direct parametric reconstruction from (k, t)-space data in dynamic contrast enhanced MRI. ISMRM 2015.
7. N Dikaios, S Arridge, S Punwani, D Atkinson. Joint direct estimation of motion and kinetic parameters from undersampled (k, t)-space data in dynamic contrast enhanced MRI. British Chaper ISMRM 2014.
8. N Dikaios, B Tremoulheac, A Menys, S Arridge, D Atkinson. Discrete shearlets as a sparsifying transform in a split Bregman reconstruction of low-rank plus sparse component from undersampled (k, t)-space small bowel data. ISMRM 2014, pp.4386.
9. A Latifoltojar, N Dikaios, A Ridout, C Moore, et al: Transrectal ultrasound guided biopsy: effect on natural history of multi-parametric MRI signal and derived quantitative parameters. ISMRM 2014, pp.969.
10. E Panagiotaki, RW Chan, N Dikaios, H Ahmed, et al Microstructural characterisation of normal and malignant human prostate tissue with VERDICT-MRI. ISMRM 2014, pp. 892.
11. N Dikaios, D Atkinson: Direct parametric reconstruction from undersampled (k, t)-space data in dynamic contrast enhancement MRI IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference (NSS/MIC), 11/2013
12. N Dikaios, B Tremoulheac, A Menys, V Hamy, S Arridge, D Atkinson: Joint reconstruction of low-rank and sparse components from undersampled (k, t)-space small bowel data IEEE Nuclear Science Symposium and Medical Imaging Conference (NSS/MIC), 11/2013
13. N Dikaios, V Hamy, S Punwani, D Atkinson. Noise estimation for averaged DW MR images. ISMRM 2013, pp.2080.
14. N Dikaios, M Abd-Alazeez, M Emberton, T Fujiwara, et al: Derivation and comparison of site specific peripheral and transition zone quantitative DCE MRI logistic regression models for prostate cancer detection: does cancer location matter? ISMRM 2013, pp.0093. - Summa Cum Laude award
15. N Dikaios, T Fujiwara, M Abd-Alazeez, D Atkinson, S Punwani. Diagnostic modelling of multi-parametric MRI as a radiological tool to predict transition zone prostate cancer. ISMRM 2012, pp.547.
16. N Dikaios, D Atkinson. Bayesian pharmacokinetic model with prior noise estimation in DCE imaging. British Chaper ISMRM 2012.
17. N Dikaios, T Fujiwara, D Atkinson, S Punwani. Artificial neural networks in radiological predictive models. ISMRM 2012, pp.2560.
18. N Dikaios, S Punwani, V Hamy, P Purpura, et al: Maximum likelihood ADC parameter estimates improve selection of metastatic cervical nodes for patients with head and neck squamous cell cancer. ISMRM 2012, pp.3579.
19. S Punwani, P Purpura, N Dikaios, H Fitzke, et al: Multi-scale analysis of apparent diffusion coefficient (ADC) predicts cervical nodal status in patients with head & neck squamous cell carcinoma. ISMRM 2012, pp.1052.
20. N Dikaios, TD Fryer: Respiratory motion correction of PET using motion parameters from MR. IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record (NSS/MIC); 11/2009
21. N Dikaios, TJ Spinks, K TJ Nikita, K Thielemans: Double Scatter Simulation using the Polarized Klein-Nishina formula.  IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record (NSS/MIC); 11/2006
22. C Tsoumpas, P Aguiar, D Ros, N Dikaios, K Thielemans: Scatter simulation including double scatter. IEEE Nuclear Science Symposium Conference Record (NSS/MIC); 11/2005
23. V Hamy, M Modat, R Shipley, N Dikaios, et al:  Multi-modal pharmacokinetic modelling for DCE-MRI: using diffusion weighted imaging to constrain the local arterial input function SPIE Medical Imaging, 90340R-90340R-8